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研究に便利なソフトウエア

2023-07-14:清野達之

0.はじめに
これは研究指導を行なっている院生・卒研生にむけて,研究を行なうあたり便利なコンピュータソフトウエアを紹介するものです.多くがWindowsな方のようですが,できるだけMacOSX, Windows, LinuxなどのOSに共通するものを中心に「フリー」なソフトウエアを紹介します.カッコ内のM, W, L はMacOSX, Windows, Linux対応という意味です.樹木を中心にした森林生態関係を主な想定としています.


1.いわゆるオフィスものまわり
  1. OpenOffice (MWL)
    http://ja.openoffice.org/
    ワープロ,表計算,ドロー,プレゼン,データベースが梱包されている.

  2. LibreOffice (MWL)
    https://www.libreoffice.org/
    上記と同様.


2.統計解析
  1. R (MWL)
    https://cran.r-project.org/
    統計解析や作図,プログラミングなど.

  2. R Studio (MWL)
    https://www.rstudio.com/
    R 用の統合開発環境.

  3. JASP (MWL)
    https://jasp-stats.org/
    統計解析.ベイズ統計を扱える.

  4. PAST (MW)
    https://www.nhm.uio.no/english/research/resources/past/
    統計解析.PAleontological STatistics の名の通り,古生物学のデータ分析環境.もちろん,一般統計解析でも使い勝手がよい.


3.文献管理
  1. Mendeley (MWL)
    https://www.mendeley.com/
    文献管理.


4.画像処理関係
  1. ImageJ (MWL)
    https://imagej.nih.gov/ij/
    画像処理ソフトウェア.スキャナで読み込んだ葉のデジタルデータから葉面積を計算したり,顕微鏡写真から読み込んだ木材解剖写真から,道管径を計算する時などに活用.

  2. PhotoRuler (W)
    http://inocybe.info/_userdata/ruler/PhotoRuler.html
    胞子の数や大きさを測定するときなど.


5.森林生態学関係
  1. カシミール (W)
    http://www.kashmir3d.com/
    GPSデータと連動できる地形図ナビゲータソフト.

  2. CanopOn2 (W)
    http://takenaka-akio.org/etc/canopon2/
    全天写真解析ソフト,国立環境研究所の竹中明夫さん作成.

  3. LIA for Win32 (LIA32) (W)
    http://www.agr.nagoya-u.ac.jp/~shinkan/LIA32/index.html
    全天写真解析ソフト,名古屋大学の山本一清さん作成.



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